たとえば、どこどこの外国株の取引ができるできないなど取引商品にも違いがあります。
また、オンラインでは証券会社ごとのトレード画面上で取引をすることになりますが、機能にも若干違いがあります。
また、口座開設者に向けてセミナーを無料で開催したり、投資情報(ニュース・レポート)が充実しているなどの
情報収集に便利なところもあるので、手数料のほかにも違いはいろいろあるのでとりあえずは、有名なところで初めてみてはいかがでしょうか。

デイトレ派なのかまったり派（？）なのかでも違ってきますよね。
一日定額の体系を用意している会社も多いですし、手数料も約定金額のあるレベルまではすごく安いけど
それ以上は急に高くなるところとか、ほぼ一定のところとか。
自分の投資スタイルによって選ぶのがいいと思いますが、最初はわからないでしょうから、まずはお試し
感覚で有名どころですかねぇ。
検索すれば比較しているサイトがいくつかあるのでそれを参考にするのもいいと思います。