値動きの上下幅はそんなに変わらないと思います。
ただ、TOPIXは東証一部の全銘柄を対象にした指数ですが、日経平均の場合は選ばれた225銘柄のみです。日経平均は電機・情報通信関連銘柄（いわゆるハイテク株）に偏っていると言われています。そのなかで大型株の変動を大きく受けやすいです。
TOPIXは全銘柄なので、中小型株の影響も受けます。

なのでその時の相場の状況によって変動が異なるので、見通しをもって買いわけてみるといいかと思います。